Page 1 of 3 123 LastLast
Results 1 to 20 of 44

Thread: Genographic Project Dari National Geographic

  1. #1
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool Genographic Project Dari National Geographic

    Genographic Project Dari National Geographic



    The Genographic Project adalah sebuah program yang diselenggarakan oleh National Geographic Society dan IBM. Ini adalah studi antropologi genetik jangka panjang yang bertujuan untuk memetakan pola migrasi sejarah manusia dengan mengumpulkan dan menganalisis sampel DNA dari orang-orang dari seluruh dunia .

    Diluncurkan pertama kali pada 13 April 2005. Proyek Genographic bergantung pada identifikasi penanda genetik dan melakukan konsultasi luas dengan kelompok-kelompok masyarakat adat dari seluruh dunia . Proyek ini bersifat non-profit dan didanai dari hasil kolaborasi antara National Geographic Society, IBM dan Waitt Family Foundation, serta ditambah juga dari sebagian hasil dari penjualan Kit Pengujian

    Sampel DNA dikumpulakan oleh peneliti lapangan di 11 pusat regional di seluruh dunia dari penduduk asli . Populasi yang berbeda memiliki penanda genetik yang berbeda. Penduduk asli memberikan konteks geografis dan budaya dengan penanda genetik dalam DNA mereka . Petunjuk ini membantu menciptakan pola migrasi manusia di masa lalu .

    Proyek ini juga membutuhkan kontribusi dari masyarakat dunia. Kita dapat ikut serta berpartisipasi dalam proyek ini dengan mengirimkan sampel DNA kita. Yang perlu dipahamai, tidak seperti tes DNA dari perusahaan-perusahan lain, tujuan dari proyek ini bukan studi genealogi, namun studi antropologi, sehingga fokusnya adalah Deep Ancestry, bukan Recent Ancestry.

    Pada tahun 2012 The Genographic Project meluncurkan tahap keduanya yang dinamakan Geno 2.0. Jika pada Tahap pertama (2005-2012) yang dianalisis adalah STR dari kromosom Y dan juga SNP dari mtDNA, maka pada tahap kedua ini The Genographic Project tidak menganalisis STR, namun fokus kepada SNP, baik SNP dari Y-Chromosome, mtDNA, maupun Autosomal DNA.

    Agustus 2015 diluncurkan tahap ketiganya yang disebut Geno 2.0 Next Generation. Secara umum produk ini hampir sama dengan Geno 2.0 namun ada penambahan jumlah SNP yang dites dari yang semula hanya sekitar 150000 SNP menjadi 750000 SNP. Penambahan SNP yang sangat besar pada autosomal DNA tersebut memungkinkan penggunaan data yang didapat untuk tujuan genealogi.



    Last edited by Parameswara Li; 16-12-2016 at 03:57 PM.

  2. #2
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool Geno 2.0 Autosomal DNA

    Berikut ini adalah contoh dari hasil analisis sampel DNA. Partisipan adalah orang Indonesia.



    Spoiler for :




    Ini adalah hasil dari analisis SNP Autosomal DNA

    Terlihat bahwa persentase Gen Asia Timur Laut cukup dominan, menandakan partisipan mempunyai leluhur Asia Timur.



    Persentase Gen Asia Tenggara juga tinggi. Tentu saja ini adalah hal wajar untuk orang Indonesia.



    Gen Asia Barat orang Indonesia kemungkinan besar berasal dari pendatang-pendatang Arab dan India.



    Sebelum kedatangan ras Mongoloid, Asia Tenggara dihuni oleh orang Melanesia sehingga wajar juga bila sebagian kecil dari mereka kemudian terserap kedalam populasi pendatang.






    Genographic Project kemudian mencocokan komposisi tersebut dengan referensi populasi yang ada pada mereka.

    Spoiler for :




    Sayang sekali untuk Asia Tenggara mereka kelihatannya hanya punya satu populasi sebagai pembanding. Genographic Project kelihatannya lebih fokus kepada wilayah lain misalnya Afrika, Eropa dan Amerika Latin.

    Komposisi Gen Asia Timur pada rata-rata orang Vietnam yang ada pada database mereka menurut saya sangat tinggi. Hal ini kemungkinan karena sampel untuk pembanding ini diambil dari penduduk Hanoi. Hanoi terletak di Vietnam bagian utara. Memang, makin ke utara penampilan orang Vietnam makin mirip Asia Timur sementara makin ke selatan makin mirip orang Asia Tenggara. Lagipula Vietnam (bagian utara) selama 1000 tahun menjadi wilayah Cina sehingga wajar sekali bila percampuran genetik sangat masif di sana. Sebagai catatan wilayah Vietnam bagian tengah tadinya adalah wilayah Campa dan wilayah Vietnam bagian selatan tadinya adalah wilayah Khmer (Kamboja).

    Komposisi DNA partisipan memang mirip dengan komposisi DNA rata-rata orang Vietnam (yang saya duga adalah dari bagian utara). Bedanya adalah bahwa partisipan mendapat unsur Asia Barat dan Oceania.

    Last edited by Parameswara Li; 16-12-2016 at 04:26 PM.

  3. #3
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool Ancient Hominid

    Teori yang berkembang sekarang adalah bahwa walaupun hominid hominid lain selain Homo sapiens sapiens telah punah, namun sebagian kecil dari mereka telah terserap ke dalam populasi Homo sapiens sapiens. Oleh karena itu dalam gen Homo sapiens sapiens saat ini ada sedikit gen yang didapat dari hominid lain. Genographic Project mencoba mengukur kadar Ancient Hominid dalam DNA kita.

    Spoiler for :






    Last edited by Parameswara Li; 16-12-2016 at 04:38 PM.

  4. #4
    pelanggan sejati ndugu's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    7,662
    wah, menarik nih

  5. #5
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool mtDNA

    Mitochondrial DNA, atau yang biasa disingkat menjadi mtDNA adalah DNA dari organisme yang ada dalam sel manusia. Penjelasannya tentu panjang sekali, jadi saya langsung saja membahas pokok masalahnya. Setiap orang mewarisi mtDNA dari ibunya sehingga bisa dikatakan bahwa mtDNA ini adalah petunjuk untuk garis keturunan dari garis ibu. Seorang anak perempuan kelak akan mewariskan mtDNAnya kepada anak-anaknya, sedangkan anak laki-laki tidak akan mewariskan mtDNA kepada anak-anaknya.

    Sama seperti semua organisme lain, DNA pada Mitokondria ini juga bermutasi. Mutasi inilah yang kemudian dianalisis untuk menentukan pola migrasi sebuah kelompok manusia.

    Spoiler for :






    Partisipan berada dalam Haplogroup F, lengkapnya F1a1. Jadi maksudnya Haplogroup F mempunyai beberapa branch, salah satunya F1.Kemudian F1 juga mempunyai branch F1a. Kemudian bercabang lagi menjadi F1a1.

    Saya lihat di hasil partisipan lain ada yang F1a1b, jadi lebih mengerucut lagi.



    Spoiler for :




    Ini adalah peta migrasi Haplogroup F



    Ini adalah daerah penyebaran Haplogroup F






    Hasil Pembandingan Dengan Partisipan Lain

    Spoiler for :




    Lingkaran di oranye di tengah adalah partisipan sedangkan lingkaran-lingkaran kecil yang lain adalah partisipan-partisipan lain. Melihat hasil komentar dari para partisipan lain, saya berkesimpulan bahwa dalam lingkaran ini semuanya F1a1.



    Spoiler for :


    Berikut ini adalah 2 dari beberapa komentar partisipan-partisipan lain.






  6. #6
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool Y-Chromosome

    Hasil Pembacaan Kromosom Y

    Kromosom Y hanya dimiliki oleh laki-laki. Laki-laki mewarisi kromosom Y dari ayah mereka dan kelak akan mewariskan kepada anak-anak laki-laki mereka. Sehingga Kromosom Y ini menjadi petunjuk untuk garis keturunan laki-laki. Genographic Project membaca dan menganalisis SNP dan bukan STR sehingga hasilnya adalah Deep Ancestry dan bukan Recent Ancestry.

    Spoiler for :




    Partisipan berada dalam Haplogroup O. Haplogroup ini eksklusif Asia Timur dan Tenggara. Sehingga sebagian besar laki-laki Asia Timur dan Tenggara termasuk dalam Haplogroup ini. Partisipan termasuk dalam O-F1982.



    SNP yang berawalan F ini adalah SNP baru sehingga belum masuk dalam daftar resmi ISOGG Y-SNP tree. SNP-SNP yang namanya berawalan F tersebut didapat dari hasil riset yang dilakukan oleh Universitas Fudan di Shanghai di bawah pimpinan Professor Jin Li.




    Pembandingan Dengan Hasil Pembacaan SNP Kromosom Y Partisipan Lain

    Spoiler for :




    Lingkaran oranye di tengah adalah partisipan, sedangkan Titik-titik lingkaran di sekelilingnya adalah partisipan-partisipan lain. Makin Jauh jarak lingkaran maka makin jauh jarak hubungannya.



    Spoiler for :


    Berikut ini 2 komentar dari partisipan-partisipan lain.






  7. #7
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool Kaitan Dengan Hominid Lain

    Teori yang berkembang sekarang adalah bahwa walaupun hominid hominid lain selain Homo sapiens sapiens telah punah, namun sebagian kecil dari mereka telah terserap ke dalam populasi Homo sapiens sapiens. Oleh karena itu dalam gen Homo sapiens sapiens saat ini ada sedikit gen yang didapat dari hominid lain. Genographic Project berusaha memperkirakan persentase hominid lain tersebut dalam gen partisipan.

    Spoiler for :





  8. #8
    pelanggan tetap Alip's Avatar
    Join Date
    May 2011
    Posts
    1,635
    Satu hal yang jadi kontroversi dari proyek ini adalah para indigenous people. Proyek ini pada dasarnya mengatakan bahwa tidak ada yang disebut 'penduduk asli' suatu daerah, karena semua penduduk sesungguhnya adalah imigran yang datang ke daerah tersebut entah berapa generasi yang lalu.

    Buat saya, ini menekankan persaudaraan semua manusia di dunia, tapi bagi beberapa orang, ini adalah ancaman bagi hak istimewa para 'penduduk asli'...
    "Mille millions de mille milliards de mille sabords!"

  9. #9
    Barista AsLan's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    9,288
    memang pada dasarnya penduduk indonesia imigran dari utara, dari sd diajarinnya begitu, jadi pribumi adalah mereka yg pertama kali menempati suatu wilayah, bukan "muncul" begitu saja.

    konsisten dengan kisah penyebaran manusia jaman menara babel, cuma beda di masalah dating.

  10. #10
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Spoiler for :





  11. #11
    Chief Cook ndableg's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    5,910
    Quote Originally Posted by Parameswara Li View Post



    Ini adalah peta migrasi Haplogroup F



    Ini adalah daerah penyebaran Haplogroup F
    Berarti bener dong, manusia sekarang semua berasal dari afrika?

  12. #12
    Chief Cook ndableg's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    5,910
    Quote Originally Posted by Alip View Post
    Satu hal yang jadi kontroversi dari proyek ini adalah para indigenous people. Proyek ini pada dasarnya mengatakan bahwa tidak ada yang disebut 'penduduk asli' suatu daerah, karena semua penduduk sesungguhnya adalah imigran yang datang ke daerah tersebut entah berapa generasi yang lalu.

    Buat saya, ini menekankan persaudaraan semua manusia di dunia, tapi bagi beberapa orang, ini adalah ancaman bagi hak istimewa para 'penduduk asli'...
    Penduduk asli mgk lebih ke kondisi di mana waktu mereka datang ke tempat itu belum ada manusia/golongan lain. Jadi bikin rumah di tanah kosong.
    Istilah anak2 jaman sekarang... pertamax!

  13. #13
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Quote Originally Posted by ndableg View Post
    Berarti bener dong, manusia sekarang semua berasal dari afrika?
    Lha itu memang dasar dari teori "Out of Africa"

    Quote Originally Posted by ndableg View Post
    Penduduk asli mgk lebih ke kondisi di mana waktu mereka datang ke tempat itu belum ada manusia/golongan lain. Jadi bikin rumah di tanah kosong.
    Istilah anak2 jaman sekarang... pertamax!
    Bisa juga ketika mereka datang sudah ada penghuni sebelumnya, tetapi sejalan dengan berjalannya waktu, penghuni sebelumnya itu kalah bersaing dan sebagian kecil terserap ke dalam populasi pendatang. Contohnya di nusantara ini. Coba anda tanya sebagian besar orang Jawa, pasti mereka bilang bahwa mereka adalah penduduk asli Jawa. Lha, padahal dahulu orang Melanesia tersebar luas di seluruh nusantara.

  14. #14
    Chief Cook ndableg's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    5,910
    Ya mungkin lebih ke lamanya waktu dan banyaknya nenek moyang.

  15. #15
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Beberapa populasi lain yang menjadi referensi :

    Spoiler for :








    Last edited by Parameswara Li; 16-12-2016 at 04:44 PM.

  16. #16
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Contoh komposisi genetik dari partisipan lain :

    Spoiler for :




    Partisipan ini mengklaim dirinya sebagai campuran antara Kolombia, Puerto Rico, dan Meksiko.


  17. #17
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Pola Migrasi Manusia Berdasarkan Haplogroup

    Spoiler for :


    Peta berikut hanya menggambarkan Haplogroup utamanya saja, tanpa cabang-cabang.

    Spoiler for :






    Spoiler for :







  18. #18
    Chief Cook ndableg's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    5,910
    Quote Originally Posted by Parameswara Li View Post
    Beberapa populasi lain yang menjadi referensi :

    Spoiler for :






    Spoiler for :






    Spoiler for :






    dst
    Kayaknya hasil2 ini ga terlalu menarik karena kita bisa liat begitu jalan keluar rumah, ke kota misalnya, melihat perbedaan2.

  19. #19
    Chief Cook ndableg's Avatar
    Join Date
    Feb 2011
    Posts
    5,910
    Quote Originally Posted by Parameswara Li View Post
    Pola Migrasi Manusia Berdasarkan Haplogroup

    Spoiler for :


    Peta berikut hanya menggambarkan Haplogroup utamanya saja, tanpa cabang-cabang.

    Spoiler for :






    Spoiler for :






    INi menarik, tapi abcd itu apa ya?

  20. #20
    pelanggan tetap Parameswara Li's Avatar
    Join Date
    Aug 2011
    Location
    天京
    Posts
    1,091

    Cool

    Quote Originally Posted by ndableg View Post
    INi menarik, tapi abcd itu apa ya?
    Ya itu nama Haplogroupnya.

    Ini klasifikasi dan asalnya secara umum

    Spoiler for :




    Mitochondiral Eve adalah most recent ancestor dari seluruh umat manusia. Bukan berarti bahwa pada masa hidupnya hanya ada satu wanita saja, tetapi bahwa semua mtDNA yang dimiliki oleh manusia sekarang ini diturunkan dari dia. Artinya adalah bahwa wanita-wanita lain yang hidup sejaman dengan dirinya, tidak berhasil melestarikan mtDNA nya sampai sekarang.

    Kemudian keturunannya terbagi dalam 2 kelompok, yaitu L0 dan L1-L6. Kemudian Kelompok L1-L6 ini terpecah menjadi beberapa kelompok. Yang kemudian sukses menjadi banyak adalah L3. Kelompok mtDNA L ini adalah mtDNA yang ada di Afrika. Kelompok L3 ini menurunkan M dan N yang kemudian eksodus ke luar Afrika. Dan begitu seterusnya.



    MRC Y-ancestor = Most recent Common Y-ancestor. Ini adalah individu yang menjadi leluhur patrilineal dari seluruh laki-laki yang hidup sekarang ini. Bukan berarti bahwa pada masa dia hidup tidak ada laki-laki lain, namun laki-laki yang lain itu Kromosom Y-nya tidak survive sampai sekarang. Sama seperti mtDNA, kelompok manusia ini terbagi menjadi 2 bagian yaitu A0 dan A1. Begitulah seterusnya. Haplogroup A dan B adalah Haplogroup Afrika. Mulai dari CT kemudian keluar dari Afrika. Untuk Kromosom Y, yang paling sukses adalah Haplogroup O karena saat ini lebih dari 80% populasi Laki-laki di Asia Timur dan Asia Tenggara adalah bagian dari Haplogroup O ini.


Page 1 of 3 123 LastLast

Posting Permissions

  • You may not post new threads
  • You may not post replies
  • You may not post attachments
  • You may not edit your posts
  •