PDA

View Full Version : Genographic Project Dari National Geographic



Parameswara Li
04-11-2013, 06:31 PM
Genographic Project Dari National Geographic

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15590339_10206533519891851_5130305907061783388_n.j pg?oh=d0440110ab25f733d0d7137ec56d82c5&oe=58E6EA93

The Genographic Project adalah sebuah program yang diselenggarakan oleh National Geographic Society dan IBM. Ini adalah studi antropologi genetik jangka panjang yang bertujuan untuk memetakan pola migrasi sejarah manusia dengan mengumpulkan dan menganalisis sampel DNA dari orang-orang dari seluruh dunia .

Diluncurkan pertama kali pada 13 April 2005. Proyek Genographic bergantung pada identifikasi penanda genetik dan melakukan konsultasi luas dengan kelompok-kelompok masyarakat adat dari seluruh dunia . Proyek ini bersifat non-profit dan didanai dari hasil kolaborasi antara National Geographic Society, IBM dan Waitt Family Foundation, serta ditambah juga dari sebagian hasil dari penjualan Kit Pengujian

Sampel DNA dikumpulakan oleh peneliti lapangan di 11 pusat regional di seluruh dunia dari penduduk asli . Populasi yang berbeda memiliki penanda genetik yang berbeda. Penduduk asli memberikan konteks geografis dan budaya dengan penanda genetik dalam DNA mereka . Petunjuk ini membantu menciptakan pola migrasi manusia di masa lalu .

Proyek ini juga membutuhkan kontribusi dari masyarakat dunia. Kita dapat ikut serta berpartisipasi dalam proyek ini dengan mengirimkan sampel DNA kita. Yang perlu dipahamai, tidak seperti tes DNA dari perusahaan-perusahan lain, tujuan dari proyek ini bukan studi genealogi, namun studi antropologi, sehingga fokusnya adalah Deep Ancestry, bukan Recent Ancestry.

Pada tahun 2012 The Genographic Project meluncurkan tahap keduanya yang dinamakan Geno 2.0. Jika pada Tahap pertama (2005-2012) yang dianalisis adalah STR dari kromosom Y dan juga SNP dari mtDNA, maka pada tahap kedua ini The Genographic Project tidak menganalisis STR, namun fokus kepada SNP, baik SNP dari Y-Chromosome, mtDNA, maupun Autosomal DNA.

Agustus 2015 diluncurkan tahap ketiganya yang disebut Geno 2.0 Next Generation. Secara umum produk ini hampir sama dengan Geno 2.0 namun ada penambahan jumlah SNP yang dites dari yang semula hanya sekitar 150000 SNP menjadi 750000 SNP. Penambahan SNP yang sangat besar pada autosomal DNA tersebut memungkinkan penggunaan data yang didapat untuk tujuan genealogi.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15400361_10206533536212259_5258005049585389970_n.j pg?oh=6bda54bab2dcbc7e855e2acab18672de&oe=58F4A7CD

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15542159_10206533532212159_2902481128981561269_n.j pg?oh=cac564cc6063d74af0be321cfe711c16&oe=58F968E9

Parameswara Li
04-11-2013, 06:57 PM
Berikut ini adalah contoh dari hasil analisis sampel DNA. Partisipan adalah orang Indonesia.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15589811_10206533591893651_547112854769355310_n.jp g?oh=a6bea95060b85539815675eca6935a60&oe=58B2BF2B



https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15541931_10206533574373213_40432896632682156_n.jpg ?oh=479ac166357e55e80162427cd3c75fdf&oe=58B103ED

Ini adalah hasil dari analisis SNP Autosomal DNA

Terlihat bahwa persentase Gen Asia Timur Laut cukup dominan, menandakan partisipan mempunyai leluhur Asia Timur.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15442292_10206533574173208_1984919629427034611_n.j pg?oh=8e3359aaaf05f936f36825a7a4854bfa&oe=58F0AD79

Persentase Gen Asia Tenggara juga tinggi. Tentu saja ini adalah hal wajar untuk orang Indonesia.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15542209_10206533575573243_570125065509996951_n.jp g?oh=2ff26e48b5033af4bdbc5f06cb479e23&oe=58B7D0C6

Gen Asia Barat orang Indonesia kemungkinan besar berasal dari pendatang-pendatang Arab dan India.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15492439_10206533575413239_7786959342513865859_n.j pg?oh=acd12f3bd93ef8f6404217a2df16b48c&oe=58B2B7F2

Sebelum kedatangan ras Mongoloid, Asia Tenggara dihuni oleh orang Melanesia sehingga wajar juga bila sebagian kecil dari mereka kemudian terserap kedalam populasi pendatang.

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15542055_10206533591733647_8027416645519744517_n.j pg?oh=f720b6fa7302bf2372f3c6f937130753&oe=58AF2319




Genographic Project kemudian mencocokan komposisi tersebut dengan referensi populasi yang ada pada mereka.



https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/l/t1.0-9/15442315_10206533591653645_17556162948080165_n.jpg ?oh=4a344989be0cac52b1f2243f8d1ec34c&oe=58F5842E

Sayang sekali untuk Asia Tenggara mereka kelihatannya hanya punya satu populasi sebagai pembanding. Genographic Project kelihatannya lebih fokus kepada wilayah lain misalnya Afrika, Eropa dan Amerika Latin.

Komposisi Gen Asia Timur pada rata-rata orang Vietnam yang ada pada database mereka menurut saya sangat tinggi. Hal ini kemungkinan karena sampel untuk pembanding ini diambil dari penduduk Hanoi. Hanoi terletak di Vietnam bagian utara. Memang, makin ke utara penampilan orang Vietnam makin mirip Asia Timur sementara makin ke selatan makin mirip orang Asia Tenggara. Lagipula Vietnam (bagian utara) selama 1000 tahun menjadi wilayah Cina sehingga wajar sekali bila percampuran genetik sangat masif di sana. Sebagai catatan wilayah Vietnam bagian tengah tadinya adalah wilayah Campa dan wilayah Vietnam bagian selatan tadinya adalah wilayah Khmer (Kamboja).

Komposisi DNA partisipan memang mirip dengan komposisi DNA rata-rata orang Vietnam (yang saya duga adalah dari bagian utara). Bedanya adalah bahwa partisipan mendapat unsur Asia Barat dan Oceania.

Parameswara Li
04-11-2013, 07:18 PM
Teori yang berkembang sekarang adalah bahwa walaupun hominid hominid lain selain Homo sapiens sapiens telah punah, namun sebagian kecil dari mereka telah terserap ke dalam populasi Homo sapiens sapiens. Oleh karena itu dalam gen Homo sapiens sapiens saat ini ada sedikit gen yang didapat dari hominid lain. Genographic Project mencoba mengukur kadar Ancient Hominid dalam DNA kita.



https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15492482_10206533584333462_3336905975712035465_n.j pg?oh=4d1c6e436abdbafa0ff48e5572757aab&oe=58B362F3

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15589656_10206533584973478_8870080165819577339_n.j pg?oh=1bbd1d69683277212bb981ad539a9803&oe=58F55BFF

ndugu
04-11-2013, 07:33 PM
wah, menarik nih :mrgreen:

Parameswara Li
04-11-2013, 08:33 PM
Mitochondrial DNA, atau yang biasa disingkat menjadi mtDNA adalah DNA dari organisme yang ada dalam sel manusia. Penjelasannya tentu panjang sekali, jadi saya langsung saja membahas pokok masalahnya. Setiap orang mewarisi mtDNA dari ibunya sehingga bisa dikatakan bahwa mtDNA ini adalah petunjuk untuk garis keturunan dari garis ibu. Seorang anak perempuan kelak akan mewariskan mtDNAnya kepada anak-anaknya, sedangkan anak laki-laki tidak akan mewariskan mtDNA kepada anak-anaknya.

Sama seperti semua organisme lain, DNA pada Mitokondria ini juga bermutasi. Mutasi inilah yang kemudian dianalisis untuk menentukan pola migrasi sebuah kelompok manusia.



https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q73/1450281_10200318142471000_169763574_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn1/q71/s720x720/553183_10200318228313146_1666492805_n.jpg

Partisipan berada dalam Haplogroup F, lengkapnya F1a1. Jadi maksudnya Haplogroup F mempunyai beberapa branch, salah satunya F1.Kemudian F1 juga mempunyai branch F1a. Kemudian bercabang lagi menjadi F1a1.

Saya lihat di hasil partisipan lain ada yang F1a1b, jadi lebih mengerucut lagi.





https://fbcdn-sphotos-b-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q79/s720x720/1395328_10200291213957804_632947776_n.jpg

Ini adalah peta migrasi Haplogroup F

https://fbcdn-sphotos-h-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q73/s720x720/521726_10200291215677847_2032925699_n.jpg

Ini adalah daerah penyebaran Haplogroup F






Hasil Pembandingan Dengan Partisipan Lain



https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q77/s720x720/1381599_10200291204997580_1879125331_n.jpg

Lingkaran di oranye di tengah adalah partisipan sedangkan lingkaran-lingkaran kecil yang lain adalah partisipan-partisipan lain. Melihat hasil komentar dari para partisipan lain, saya berkesimpulan bahwa dalam lingkaran ini semuanya F1a1.





Berikut ini adalah 2 dari beberapa komentar partisipan-partisipan lain.

https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q82/s720x720/1392748_10200291209557694_513263568_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-f-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn1/q79/s720x720/1385467_10200291208997680_1165804884_n.jpg

Parameswara Li
04-11-2013, 09:27 PM
Hasil Pembacaan Kromosom Y

Kromosom Y hanya dimiliki oleh laki-laki. Laki-laki mewarisi kromosom Y dari ayah mereka dan kelak akan mewariskan kepada anak-anak laki-laki mereka. Sehingga Kromosom Y ini menjadi petunjuk untuk garis keturunan laki-laki. Genographic Project membaca dan menganalisis SNP dan bukan STR sehingga hasilnya adalah Deep Ancestry dan bukan Recent Ancestry.



https://fbcdn-sphotos-e-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q72/1390739_10200318142070990_533349224_n.jpg

Partisipan berada dalam Haplogroup O. Haplogroup ini eksklusif Asia Timur dan Tenggara. Sehingga sebagian besar laki-laki Asia Timur dan Tenggara termasuk dalam Haplogroup ini. Partisipan termasuk dalam O-F1982.

https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q83/s720x720/1460016_10200318485519576_565067925_n.jpg

SNP yang berawalan F ini adalah SNP baru sehingga belum masuk dalam daftar resmi ISOGG Y-SNP tree. SNP-SNP yang namanya berawalan F tersebut didapat dari hasil riset yang dilakukan oleh Universitas Fudan di Shanghai di bawah pimpinan Professor Jin Li.




Pembandingan Dengan Hasil Pembacaan SNP Kromosom Y Partisipan Lain



https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1381929_10200291206357614_667014123_n.jpg

Lingkaran oranye di tengah adalah partisipan, sedangkan Titik-titik lingkaran di sekelilingnya adalah partisipan-partisipan lain. Makin Jauh jarak lingkaran maka makin jauh jarak hubungannya.





Berikut ini 2 komentar dari partisipan-partisipan lain.

https://fbcdn-sphotos-e-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q79/1384134_10200291204837576_2142425015_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1390622_10200291209317688_1292511658_n.jpg

Parameswara Li
05-11-2013, 01:31 AM
Teori yang berkembang sekarang adalah bahwa walaupun hominid hominid lain selain Homo sapiens sapiens telah punah, namun sebagian kecil dari mereka telah terserap ke dalam populasi Homo sapiens sapiens. Oleh karena itu dalam gen Homo sapiens sapiens saat ini ada sedikit gen yang didapat dari hominid lain. Genographic Project berusaha memperkirakan persentase hominid lain tersebut dalam gen partisipan.



https://fbcdn-sphotos-b-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1390521_10200258741386310_2019257449_n.jpg

Alip
05-11-2013, 09:33 AM
Satu hal yang jadi kontroversi dari proyek ini adalah para indigenous people. Proyek ini pada dasarnya mengatakan bahwa tidak ada yang disebut 'penduduk asli' suatu daerah, karena semua penduduk sesungguhnya adalah imigran yang datang ke daerah tersebut entah berapa generasi yang lalu.

Buat saya, ini menekankan persaudaraan semua manusia di dunia, tapi bagi beberapa orang, ini adalah ancaman bagi hak istimewa para 'penduduk asli'...

AsLan
05-11-2013, 12:26 PM
memang pada dasarnya penduduk indonesia imigran dari utara, dari sd diajarinnya begitu, jadi pribumi adalah mereka yg pertama kali menempati suatu wilayah, bukan "muncul" begitu saja.

konsisten dengan kisah penyebaran manusia jaman menara babel, cuma beda di masalah dating.

Parameswara Li
05-11-2013, 06:20 PM
http://www.youtube.com/watch?v=lxgS9RKwKbU

ndableg
05-11-2013, 07:29 PM
https://fbcdn-sphotos-b-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q79/s720x720/1395328_10200291213957804_632947776_n.jpg

Ini adalah peta migrasi Haplogroup F

https://fbcdn-sphotos-h-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q73/s720x720/521726_10200291215677847_2032925699_n.jpg

Ini adalah daerah penyebaran Haplogroup F



Berarti bener dong, manusia sekarang semua berasal dari afrika?

ndableg
05-11-2013, 07:34 PM
Satu hal yang jadi kontroversi dari proyek ini adalah para indigenous people. Proyek ini pada dasarnya mengatakan bahwa tidak ada yang disebut 'penduduk asli' suatu daerah, karena semua penduduk sesungguhnya adalah imigran yang datang ke daerah tersebut entah berapa generasi yang lalu.

Buat saya, ini menekankan persaudaraan semua manusia di dunia, tapi bagi beberapa orang, ini adalah ancaman bagi hak istimewa para 'penduduk asli'...

Penduduk asli mgk lebih ke kondisi di mana waktu mereka datang ke tempat itu belum ada manusia/golongan lain. Jadi bikin rumah di tanah kosong.
Istilah anak2 jaman sekarang... pertamax!

Parameswara Li
05-11-2013, 07:47 PM
Berarti bener dong, manusia sekarang semua berasal dari afrika?

Lha itu memang dasar dari teori "Out of Africa"


Penduduk asli mgk lebih ke kondisi di mana waktu mereka datang ke tempat itu belum ada manusia/golongan lain. Jadi bikin rumah di tanah kosong.
Istilah anak2 jaman sekarang... pertamax!

Bisa juga ketika mereka datang sudah ada penghuni sebelumnya, tetapi sejalan dengan berjalannya waktu, penghuni sebelumnya itu kalah bersaing dan sebagian kecil terserap ke dalam populasi pendatang. Contohnya di nusantara ini. Coba anda tanya sebagian besar orang Jawa, pasti mereka bilang bahwa mereka adalah penduduk asli Jawa. Lha, padahal dahulu orang Melanesia tersebar luas di seluruh nusantara.

ndableg
05-11-2013, 10:03 PM
Ya mungkin lebih ke lamanya waktu dan banyaknya nenek moyang.

Parameswara Li
06-11-2013, 11:50 PM
Beberapa populasi lain yang menjadi referensi :



https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/14600993_10206533651375138_1877443321390980680_n.j pg?oh=1995d1908a15ff0f0337048124a5f50f&oe=58EAD8F3

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15492330_10206533650695121_5972602618863468819_n.j pg?oh=cc90fe0b81bb3aa3d5bea1f2387cfc0e&oe=58AEF019

https://scontent-sin6-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15621960_10206533650455115_8953447909398979775_n.j pg?oh=84b8b6e6e4bb738784f58d51ffa2537c&oe=58F06027

Parameswara Li
07-11-2013, 03:07 PM
Contoh komposisi genetik dari partisipan lain :



http://www.naturallycurly.com/curltalk/attachments/non-hair-discussion/31456d1360980039-has-anyone-participated-genographic-project-2-0-genetic-breakdown.jpg

Partisipan ini mengklaim dirinya sebagai campuran antara Kolombia, Puerto Rico, dan Meksiko.

Parameswara Li
07-11-2013, 05:14 PM
Pola Migrasi Manusia Berdasarkan Haplogroup



Peta berikut hanya menggambarkan Haplogroup utamanya saja, tanpa cabang-cabang.



https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1393724_10200273719560755_851094723_n.jpg





https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1457496_10200273720160770_140990733_n.jpg

ndableg
07-11-2013, 06:51 PM
Beberapa populasi lain yang menjadi referensi :



https://fbcdn-sphotos-b-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/541798_10200269442413829_203385030_n.jpg





https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/969348_10200269497695211_1425263556_n.jpg





https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/1457472_10200269498255225_925578627_n.jpg



dst


Kayaknya hasil2 ini ga terlalu menarik karena kita bisa liat begitu jalan keluar rumah, ke kota misalnya, melihat perbedaan2.

ndableg
07-11-2013, 06:53 PM
Pola Migrasi Manusia Berdasarkan Haplogroup



Peta berikut hanya menggambarkan Haplogroup utamanya saja, tanpa cabang-cabang.



https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1393724_10200273719560755_851094723_n.jpg





https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1457496_10200273720160770_140990733_n.jpg





INi menarik, tapi abcd itu apa ya?

Parameswara Li
07-11-2013, 07:54 PM
INi menarik, tapi abcd itu apa ya?

Ya itu nama Haplogroupnya.

Ini klasifikasi dan asalnya secara umum



https://fbcdn-sphotos-e-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/547852_10200274187932464_269044807_n.jpg

Mitochondiral Eve adalah most recent ancestor dari seluruh umat manusia. Bukan berarti bahwa pada masa hidupnya hanya ada satu wanita saja, tetapi bahwa semua mtDNA yang dimiliki oleh manusia sekarang ini diturunkan dari dia. Artinya adalah bahwa wanita-wanita lain yang hidup sejaman dengan dirinya, tidak berhasil melestarikan mtDNA nya sampai sekarang.

Kemudian keturunannya terbagi dalam 2 kelompok, yaitu L0 dan L1-L6. Kemudian Kelompok L1-L6 ini terpecah menjadi beberapa kelompok. Yang kemudian sukses menjadi banyak adalah L3. Kelompok mtDNA L ini adalah mtDNA yang ada di Afrika. Kelompok L3 ini menurunkan M dan N yang kemudian eksodus ke luar Afrika. Dan begitu seterusnya.

https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/1426533_10200274188012466_2005401487_n.jpg

MRC Y-ancestor = Most recent Common Y-ancestor. Ini adalah individu yang menjadi leluhur patrilineal dari seluruh laki-laki yang hidup sekarang ini. Bukan berarti bahwa pada masa dia hidup tidak ada laki-laki lain, namun laki-laki yang lain itu Kromosom Y-nya tidak survive sampai sekarang. Sama seperti mtDNA, kelompok manusia ini terbagi menjadi 2 bagian yaitu A0 dan A1. Begitulah seterusnya. Haplogroup A dan B adalah Haplogroup Afrika. Mulai dari CT kemudian keluar dari Afrika. Untuk Kromosom Y, yang paling sukses adalah Haplogroup O karena saat ini lebih dari 80% populasi Laki-laki di Asia Timur dan Asia Tenggara adalah bagian dari Haplogroup O ini.

Parameswara Li
07-11-2013, 09:06 PM
Kayaknya hasil2 ini ga terlalu menarik karena kita bisa liat begitu jalan keluar rumah, ke kota misalnya, melihat perbedaan2.

Bukan begitu maksudnya. Yang dijadikan sample hanya penduduk setempat. DNA tidak bisa dilihat dengan kasat mata, harus dibaca dan dianalisis dengan peralatan canggih. Itu komposisi genetik populasi maksudnya bukan komposisi rasial dari suatu sekelompok penduduk di daerah tertentu, tetapi rata-rata komposisi genetik dari suatu populasi.

Jadi misalnya mereka mau menjadikan populasi Bali sebagai salah satu populasi referensi maka yang akan diambil samplenya sebagai data hanya orang Bali yang turun termurun asli Bali saja. Yang keturunan lain tidak dipakai sebagai sample. Tentu saja dalam hasil yang kemudian keluar kemungkinan besar tidak hanya SNP Asia Timur Laut dan Asia Tenggara saja yang muncul.

Sample dasar untuk menenentukan komposisi genetik berbeda dengan partisipan. Kalau partisipan itu diharapkan memberikan kontribusinya berupa sample DNA namun tidak akan digabung ke dalam sample dasar untuk menentukan komposisi genetik tadi. Mereka hanya akan dibandingkan dengan rata-rata komposisi genetik dari populasi yang paling mirip secara genetik dengan si partisipan.

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/969348_10200269497695211_1425263556_n.jpg

Maksud dari komposisi ini bukannya 47% penduduk Bulgaria mempunyai leluhur dari mediterania dan 31% dari Eropa Utara. Tetapi dari populasi Bulgaria yang mereka teliti, dalam diri setiap orang yang diteliti itu rata-rata terdapat 47% SNP yang disimpulkan merupakan SNP asli mediterania dan 31% SNP yang disimpulkan merupakan SNP aslli dari Eropa Utara. Dan ini tidak bisa dilihat secara kasat mata. Untuk sample dari Bulgaria ini mereka hanya kumpulkan dari orang-orang yang sudah turun temurun hidup dan tinggal di situ. Jadi kalau ada imigran dari Asia atau Afrika yang ada di situ maka tidak akan diikutkan untuk menghitung rata-rata komposis genetik.

https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1381308_10200291201077482_1473272560_n.jpg

Contoh ini sudah saya tampilkan dalam posting #2. Disitu saya katakan partisipan adalah orang Indonesia. Nah, bukan berarti bahwa 5% orang Indonesia itu adalah keturunan Asia Barat dan 4% adalah adalah keturunan Oceania. Terus terang saya agak kuatir kalau ternyata banyak yang salah tangkap seperti itu. Karena itu berarti saya kurang jelas dalam menerangkannya.

Hasil di atas adalah hasil analisis DNA dari Mr. X. Mr. X adalah Warga Negara Indonesia, lahir di Indonesia, ayah dan ibunya juga lahir di Indonesia. Kakek nenek juga lahir di Indonesia. Nah dari SNP yang diteliti berdasarkan sample DNA yang dikirimkan Mr. X ke laboratorium di Houston, Texas, maka disimpulkan bahwa terdapat 5% SNP yang oleh Genographic Project disimpulkan berasal dari populasi asli Asia Barat dan 4 % SNP yang berasal dari populasi asli Oceania. Tentu saja SNP yang dominan dalam diri Mr. X adalah SNP yang berasal dari populasi Asia Timur Laut.

Kalau anda mengirimkan sample DNA ke Houston, Texas tersebut maka sample tersebut akan dibaca dan dianalisis. Dan dicocokkan dengan referensi populasi yang ada pada database mereka. Referensi populasi itu adalah referensi genetik rata-rata, jadi bukan profil rasial dari penduduk suatu tempat.

ndableg
07-11-2013, 09:55 PM
Ouwh.. jadi per orang.. dari satu orang bisa dilihat dr dna nya kalau SNP asalnya dr mana saja gitu? Kalo yg belasteran indo gitu bisa lebih warna warni dong..?

Parameswara Li
07-11-2013, 10:16 PM
Ouwh.. jadi per orang.. dari satu orang bisa dilihat dr dna nya kalau SNP asalnya dr mana saja gitu? Kalo yg belasteran indo gitu bisa lebih warna warni dong..?

Karena ini tujuannya adalah penelitian antropologi dan bukan genealogi, maka Genographic Project hanya menggolongkan asal SNP ke dalam 9 populasi dasar. Ini ada contoh orang yang SNP DNA nya cukup berwarna-warni.

https://fbcdn-sphotos-e-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1465406_10200273507275448_594257737_n.jpg

Parameswara Li
08-11-2013, 07:35 PM
Di sini tidak ada yang penasaran dengan Kromosom Y atau Mitokondria DNA dirinya ? :ngopi:

kandalf
08-11-2013, 07:58 PM
Saya penasaran.
Mendaftar di mana?

Parameswara Li
08-11-2013, 08:31 PM
Saya penasaran.
Mendaftar di mana?

https://genographic.nationalgeographic.com/

Nah, disitu lengkap penjelasannya. Terus terang saya juga ingin tahu orang Indonesia yang lain bagaimana Komposisi SNP Autosomal dan Haplotype Kromosom Y nya. ::hihi::

Terus terang saya ingin tahu 48% Northeast Asian itu termasuk tinggi atau rendah untuk ukuran Indonesia. Kalau untuk keturunan Cina, itu termasuk rendah karena untuk Cina Selatan persentase Northeast Asian biasanya sekitar 60an%, Sedangkan Cina Utara sekitar 70an%. Tapi saya tidak tahu untuk orang Cina peranakan (yang sudah bercampur dengan orang setempat) berapa rata-rata persentase Northeast Asian nya.

Parameswara Li
11-11-2013, 07:32 PM
Ini bukan hasil penelitian dari Genographic Project, namun jelas berkaitan dengan DNA. Kromosom Y Napoleon termasuk dalam Haplogroup E1b1b1b2a1 (E-M34). Nomenclature berdasarkan ISOGG 2012.



https://fbcdn-sphotos-e-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/1468720_10200291983697347_1842014519_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1451334_10200291968096957_484023939_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/1453538_10200292025658396_470122770_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc1/q71/1005006_10200291980097257_186015145_n.jpg

Parameswara Li
12-11-2013, 02:06 AM
Kasus Thomas Jefferson & Sally Hemings




http://www.youtube.com/watch?v=RHXUlDUbq8k

Parameswara Li
13-11-2013, 08:36 PM
Ya mungkin lebih ke lamanya waktu dan banyaknya nenek moyang.

Ya itu debatable juga. Yang jelas ada populasi yang mengklaim wilayah yang sudah lama didiami oleh populasi lain setelah mereka.

Parameswara Li
14-11-2013, 01:56 PM
Beberapa komentar dari partisipan berkaitan dengan Kromosom Y mereka.



Kolom paling kiri adalah nama Terminal SNP. Yaitu mutasi terakhir pada Kromosom Y yang sudah diketahui.

https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1471324_10200306134971120_837538417_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/s720x720/1472046_10200306135091123_432426882_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1451977_10200306135331129_1751219099_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn1/q71/s720x720/556863_10200306157771690_1634780788_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash4/q71/s720x720/1001285_10200306158171700_571780879_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-f-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1460280_10200306158211701_489366978_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/s720x720/1452418_10200306135971145_1625906744_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-f-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1453429_10200306135811141_1213724761_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-d-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn1/q71/s720x720/994665_10200306135691138_1649775188_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-c-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1467349_10200306135531134_2060350208_n.jpg

Parameswara Li
17-11-2013, 03:57 PM
https://fbcdn-sphotos-g-a.akamaihd.net/hphotos-ak-ash3/q71/s720x720/579650_10200336454329085_1458588202_n.jpg

ndableg
17-11-2013, 04:55 PM
Ya itu debatable juga. Yang jelas ada populasi yang mengklaim wilayah yang sudah lama didiami oleh populasi lain setelah mereka.

Jadi misalnya gini pak.
Ketika bangsa eropa datang ke australia, bangsa aborigin sudah 40ribu taun tinggal di australia. Artinya aborigin lebih native drpd orang eropa, karena sudah ribuan taun tinggal di sana, walaupun australia jutaan taun lalu dihuni dinosaurus misalnya..

ndableg
17-11-2013, 05:32 PM
Di sini tidak ada yang penasaran dengan Kromosom Y atau Mitokondria DNA dirinya ? :ngopi:

Karena ud bisa bayangin lah.. ga mungkin gw ada gen eropa gituh..

Parameswara Li
17-11-2013, 06:15 PM
Jadi misalnya gini pak.
Ketika bangsa eropa datang ke australia, bangsa aborigin sudah 40ribu taun tinggal di australia. Artinya aborigin lebih native drpd orang eropa, karena sudah ribuan taun tinggal di sana, walaupun australia jutaan taun lalu dihuni dinosaurus misalnya..

Kalau untuk kasus Australia tentu sudah jelas bahwa orang yang diakui sebagai penduduk asli adalah kaum Aborigin karena sampai saat ini tidak ada bukti yang menyatakan ada kelompok manusia lain yang tinggal di sana sebelum mereka. Namun seandainyapun kelak ditemukan bukti tentang keberadaan hominid lain yang pernah menghuni tanah tersebut juga tetap saja tidak mengubah posisi aborigin sebagai penduduk asli karena walaupun seandainya pernah ada hominid lain tentu mereka semua sudah punah sekarang dan tidak mungkin membuat klaim.

Tetapi untuk ras Mongoloid yang menghuni Asia Tenggara baik di benua Asia maupun kepulauan maka masih ada yang lebih native dari mereka, seperti kaum negrito yang jumlahnya tinggal sedikit, dan juga kelompok melanesia yang kemudian terdesak jauh ke timur.


Karena ud bisa bayangin lah.. ga mungkin gw ada gen eropa gituh..

Kalau tentang autosomal DNA, tentu sudah pasti. Seandainyapun ada gen eropa pasti sudah lebur ke dalam gen lokal. Namun untuk Kromosom Y dan mtDNA itu belum tentu. Dari hasil salah satu penelitian di Bali dimana yang diteliti adalah orang Bali yang sudah dari sejak jaman nenek moyang memang sudah jadi orang Bali, didapat hasil sebagai berikut :

83.7 % dari mereka mempunyai kromosom Y khas Mongoloid yaitu O [O-M95, O-119, dan O-M122)
2.2% dari mereka mempunyai kromosom Y khas orang-orang Melanesia yaitu K-M9, K-M230, dan M.
12 % dari mereka mempunyai kromosom Y yang berasal dari Asia Barat dan Selatan yaitu H, J, L, and R.

Saya rasa untuk orang Jawa, komposisi Haplogroup Kromosom Y juga tidak akan jauh berbeda dari itu.

Jadi begini, kromosom Y itu diwariskan dari ayah ke anak laki-lakinya dan tidak bercampur (istilahnya tidak mengalami rekombinasi) dengan kromosom-kromosom yang lain (yang disebut autosom). Jadi bila misalnya dahulu ada laki-laki Belanda yang kromosom Y nya adalah termasuk Haplogroup I menikah dengan wanita Jawa, kemudian keturunan laki-lakinya menikah juga dengan wanita Jawa, begitu terus sampai 6 generasi maka dapat dipastikan bahwa autosomal DNA keturunan generasi ke 6 itu akan sama persis dengan orang-orang Jawa yang lain, namun kromosom Y nya tetap sama (dengan sedikit mutasi pada STRnya) dengan laki-laki Belanda yang menjadi leluhurnya tersebut.

Karena di Indonesia tidak ada tradisisi pencatatan, maka sangat mungkin tidak sedikit di antara laki-laki Indonesia yang mempunyai Kromosom Y Eropa. Apalagi jaman dahulu tidak semua keturunan Eropa masuk menjadi bagian dari masyarakat Indo-Belanda. Banyak juga yang kemudian memilih untuk melebur ke dalam masyarakat lokal. Karena di Indonesia tidak ada budaya membuat silsilah di kalangan rakyat (yang punya kebiasaan mempunyai silsilah hanya kelompok elite saja), maka hal ini kemudian tidak diketahui oleh keturunan mereka.

Untuk kromosom Y ini kadang-kadang hasilnya cukup mengejutkan. di FTDNA misalnya ada Aryan Project yang diikuti tentu saja oleh orang yang merasa dirinya adalah orang Arya Jerman. Nah ternyata ada diantara mereka yang kromosom Y nya adalah C3 yang merupakan kromosom Y khas orang Mongolia (Kromosom Y Genghis Khan adalah C3). Padahal saya yakin secara fisik orang tersebut pasti sama dengan orang Arya Jerman yang lain, hanya Kromosom Y nya berbeda. Kemungkinan merupakan sisa-sisa dari penyerbuan pasukan Mongol ke Eropa. Tentu saja orang Mongol tidak mencapai Jerman namun keturunan Mongol di Eropa Timur kemudian menyebar juga ke Eropa Barat.

ndableg
17-11-2013, 06:44 PM
iya maksud saya DNA, Kromosom Y, dlsbgnya itu.. ::hihi::

Parameswara Li
17-11-2013, 07:25 PM
iya maksud saya DNA, Kromosom Y, dlsbgnya itu.. ::hihi::

Ya kalau orang Indonesia bagian barat sih kemungkinan besar memang Haplogroup O. Tetapi O itu kan banyak cabangnya. Misalnya O-M119, itu mayoritas di Nias (Karafet(2010):100%, VanOven(2011):99.8%), Mentawai (Karafet(2010):86.5%), tetapi tidak terlalu banyak di Jawa (Kayser(2003):23%, Karafet(2010):14.8%)



Pohon Haplogroup O Tahun 2013.



Ini adalah Pohon Haplogroup O Tahun 2013. Tahun 2014 akan terjadi banyak perubahan karena Universitas Fudan dan Chris Tyler Smith menemukan ribuan SNP baru yang belum dimasukan secara resmi. F adalah initial untuk Fudan, CTS adalah initial untuk Chris Tyler Smith.

https://fbcdn-sphotos-h-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1469987_10200337285069853_823626090_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-f-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1426570_10200337284589841_624955117_n.jpg

lattungtatturrus
17-11-2013, 10:33 PM
*punyeng
Mau nanya nih om...
Gimana dengan orang batak yg pake marga... Mereka kan ada pencatatan silsilah ampe beberapa puluh generasi ke atas tuh...ampe marga tersebut muncul pertama sekali...

mbok jamu
18-11-2013, 02:56 PM
Hmm.. Interesting. :mikir:

Kira-kira berapa persen Gujarat, Kedah, Batak dan Minang sama mbok ya?

Parameswara Li
18-11-2013, 08:34 PM
Hmm.. Interesting. :mikir:

Kira-kira berapa persen Gujarat, Kedah, Batak dan Minang sama mbok ya?

Ada juga orang yang berdarah Minang atau Gujarat yang ikut serta




https://fbcdn-sphotos-f-a.akamaihd.net/hphotos-ak-prn2/q71/s720x720/1459047_10200345597757665_1481964491_n.jpg

https://fbcdn-sphotos-a-a.akamaihd.net/hphotos-ak-frc3/q71/s720x720/1466070_10200345592997546_420310354_n.jpg

Parameswara Li
01-12-2013, 03:13 AM
Origins, age, spread and ethnic association of European haplogroups and subclades

http://www.muturzikin.com/documents/Origins,%20age,%20spread%20and%20ethnic%20associat ion%20of%20European%20haplogroups%20and%20subclade s.pdf

Parameswara Li
10-12-2013, 07:39 PM
Contoh Hasil Tes Secara Singkat [Summary]




https://scontent-sit4-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15590621_10206533420529367_1717230814073522818_n.j pg?oh=eb71995248615b50c5aa49798af06f93&oe=58F2F3FD

https://scontent-sit4-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15492262_10206533415049230_3853138302623615529_n.j pg?oh=553586cfa8af6593b41192d604a08f52&oe=58B0198E

https://scontent-sit4-1.xx.fbcdn.net/v/t1.0-9/15492262_10206533415049230_3853138302623615529_n.j pg?oh=553586cfa8af6593b41192d604a08f52&oe=58B0198E

yanwok
12-12-2013, 03:22 PM
http://shop.nationalgeographic.com/ngs/browse/productDetail.jsp?productId=2001246&gsk&code=MR20944


BY PARTICIPATING, YOU WILL:
• Discover the migration paths your ancient ancestors followed hundreds—even thousands—of years ago, with an unprecedented view of your ancestral journey.
• Learn what percentage of your genome is affiliated with specific regions of the world.
• Find out if you have Neanderthal or Denisovan ancestry.
• Have the opportunity to share your story and connect with other Genographic Project participants, helping us fill in the gaps in the human story.
WHAT'S INCLUDED IN THE GENO 2.0 DNA TEST KIT:
The Geno 2.0 kit contains everything you need to begin the journey into your past, including painless cheek swabs and instructions for submitting your DNA samples (return postage required). Plus, we’ve designed the Geno 2.0 kit box to serve as a beautiful keepsake to store your results after you access them online.

HOW YOUR PARTICIPATION HELPS THE GENOGRAPHIC PROJECT:
The Genographic Project is an ambitious attempt to help answer fundamental questions about where humankind originated and how we came to populate the Earth. Using the latest genetic and computational technologies to analyze historical patterns in DNA from participants around the world, our team of world-renowned scientists led by Dr. Spencer Wells, seeks to reveal our migratory history and to better understand the connections and differences that make up humankind.

Parameswara Li
17-12-2013, 12:40 PM
World Map of Y-DNA Haplogroups



http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/ca/World_Map_of_Y-DNA_Haplogroups.png

Parameswara Li
16-12-2016, 03:17 PM
Aduh, account tempat menyimpan gambarnya sudah tidak ada, jadi gambarnya blank semua.